從1590年詹森發明zui原始的復式顯微鏡以來，特別是在近幾十年由于現代科學技術的飛速發展，顯微鏡的研究和制造技術進展很快，不僅它的精密度和分辨力大大提高，而且制造出了適用于各種用途的顯微鏡。就光學顯微鏡來說，可以分為可見光顯微鏡和不可見光.顯微鏡兩大類。

    （1）可見光顯微鏡。是指利用光講的可見光部分（380-760n m波長范圍）形成像的顯微鏡。它根據照明技術、成像技術和鏡體構造的不同又可以分為很多種。

    根據顯微鏡的照明技術可以分為:

    明視野顯微鏡:這就是前面所提到的普通顯微鏡，它是顯微鏡中zui基本zui普遍的類型。其它各種類型的特種顯微鏡都是由它演變而來的，或者只要在這種顯微鏡上附加或更換特殊的附件就可以變為其它顯微鏡。

    暗視野顯微鏡:這種顯微鏡利用特殊的集光器使照明光線不能直接進入物鏡，只有標本表面的散射光進入物鏡，因此整個視野的背景是暗的。用這種顯微鏡能夠觀察到明視野顯微鏡所無法分辨的微小顆粒（ 0.1-x-0.015m ），因此多用于微生物和膠體微粒的觀察。

    熒光顯微鏡:這是一種利用一定波長的光使標本的特異性物質受到激發而發射熒光，通過觀察熒光研究標本的特異性物質成分或標本的特異結構的顯微鏡。這種顯微鏡具有特殊的照明系統、熒光垂直照明器以及暗視野集光器。

 根據像的形成技術可以分為:

    相差顯微鏡:這是一種使光波通過樣品時波長與振幅發生變化，以增大物體的明暗反差，用來觀察未染色的活體細胞和組織細微結構的顯微鏡。這種顯微鏡具有特殊的相差集光器和相差物鏡。

    干涉相差顯微鏡:這種顯微鏡使通過標本的光線和通過標本之外的光線發生干涉并把光的相位變化變為振幅變化，從而可以觀察染色或未染色物體的細微結構并能測定標本中干物質的含量。

    偏光顯微鏡:這是一種利用偏振光原理來觀察具有雙折射特性物質的顯微鏡。這種顯微鏡多用于礦物學和巖石學，在生物學和醫學中可用于觀察和研究具雙折射特性的纖維蛋白、淀粉粒、紡捶絲等結構。

    根據鏡體構造可以分為:

    倒置顯微鏡:這是一種把照明系統置于載物臺上面，把物鏡置于載物臺下面的顯微鏡。這種顯微鏡由于大大加長了物臺上放置樣品的高度，可以放置培養器皿。因此多用于觀察培養的活體細胞和組織。

    實體顯微鏡:這是一種利用斜射光照明觀察物體的外部形態和立體結構的顯微鏡。這種顯微鏡放大倍數較低，一般為60-500 x。但它的應用范圍非常廣泛，可用于工農業生產及科學文化事業的許多領域。

    比較顯微鏡:這實際上是一種合并在一個鏡架上的兩臺顯微鏡，但是它可以把兩個;示本的像借助于棱鏡組合在一個目鏡的兩半視野內，用以比較兩個標本的結構和染色。

    （2）不可見光顯微鏡。這是一類利用光譜的可見光部分以外的非可見光形成像的顯微鏡。這類顯微鏡是近二十年內發展起來的特殊用途的顯微鏡，它可以分為:

    紫外光顯微鏡:這是一種使用波長在380-360nm以下的紫外光形成物體像的顯微鏡。它zui初被用于增大分辨力，現在主要用于對紫外光有選擇吸收物質的顯微光度和顯微分光光度的研究。

    紅外光顯微鏡:這是一種使用波長在760-1,500nm范圍內的紅外光形成物體像的顯徽鏡。它可以使用可見光觀察不透明的一定的物質變得透明，例如可用于研究昆蟲中滲入黑色素的甲殼質層。

    X一射線顯微鏡:這是一種利用波長極短（0.01---100人）而具強大穿透力的X一射線來形成物體像的顯微鏡。它可以用來觀察較厚標本中的空間結構以及礦質化或角質化的材料。

    在光學顯微鏡中除了上述的分類方法而外，根據顯微鏡的使用范圍和性能的高低還

可以分為教學顯微鏡、研究顯微鏡和大型顯微鏡。大型顯微鏡可以裝配各種附

件而兼備多種顯微鏡的用途。